Публикации Публикации сотрудников

1. Pavel Davidovich (1) , Conor J. Kearney (2)  and Seamus J. Martin (1,2)

Inflammatory outcomes of apoptosis, necrosis and necroptosis

(1) Cellular Biotechnology Laboratory, Saint-Petersburg State Institute of Technology,  Moskovskii prospekt., St. Petersburg, Russia  

(2) Molecular Cell Biology Laboratory, Dept. of Genetics, The Smurfit Institute, Trinity College, Dublin 2, Ireland 

Linkhttp://www.degruyter.com/view/j/bchm.2014.395.issu...

Published:  2014

Citation Information

Biological Chemistry. Volume 395, Issue 10, Pages 1163–1171. doi: 10.1515/hsz-2014-0164, August 2014

Abstract 

Microbial infection and tissue injury are well established as the two major drivers of inflammation. However, although it is well established that necrotic cell death can trigger or potentiate inflammation, precisely how this is achieved still remains relatively obscure.

Certain molecules, which have been dubbed ‘damage-associated molecular patterns’ (DAMPs) or alarmins, are thought to promote inflammation upon release from necrotic cells.

However, the precise nature and relative potency of DAMPs, compared to conventional pro-inflammatory cytokines or pathogen-associated molecular patterns (PAMPs), remains unclear. How different modes of cell death impact on the immune system also requires further clarification. Apoptosis has long been regarded as a non-inflammatory or even anti-inflammatory mode of cell death, but recent studies suggest that this is not always the case. Necroptosis is a programmed form of necrosis that is engaged under certain conditions  when caspase activation is blocked. Necroptosis is also regarded as a highly pro-inflammatory mode of cell death but there has been little explicit examination of this issue. Here we discuss the inflammatory implications of necrosis, necroptosis and apoptosis and some of the unresolved questions concerning how dead cells influence inflammatory responses. 

Keywords

Alarmins, apoptosis, cell death, danger, necrosis, necroptosis, damage-associated molecular patterns, inflammation. 

2. Conor J. Kearney (1), Sean P. Cullen (1), Danielle Clancy(1) and Seamus J. Martin(1,2)

RIPK1 can function as an inhibitor rather than an initiator of RIPK3-dependent necroptosis

(1) Molecular Cell Biology Laboratory, Department of Genetics, The Smurfit Institute, Trinity College, Dublin, Ireland

(2) Cellular Biotechnology Laboratory, Saint-Petersburg State Institute of Technology, Moskovskii Prospekt, Russia

Link:  http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/febs.13...

Published: 2014

Citation Information

FEBS Journal, 281: 4921–4934. doi: 10.1111/febs.13034

Abstract

Tumour necrosis factor and lipopolysaccharide can promote a regulated form of necrosis, called necroptosis, upon inhibition of caspase activity in cells expressing receptor-interacting serine/threonine kinase (RIPK)3. Because inhibitors of RIPK1 kinase activity such as necrostatin-1 block necroptosis in many settings, RIPK1 is thought to be required for activation of RIPK3, leading to necroptosis. However, here we show that, although necrostatin potently inhibited tumour necrosis factor-induced, lipopolysaccharide-induced and polyIC-induced necroptosis, RIPK1 knockdown unexpectedly potentiated this process. In contrast, RIPK3 knockdow potently suppressed necroptosis under the same conditions.

Significantly, necrostatin failed to block necroptosis in the absence of RIPK1, indicating that its ability to suppress necroptosis was indeed RIPK1-dependent. These data argue that RIPK1 is dispensable for necroptosis and can act as an inhibitor of this process. Our observations also suggest that necrostatin enhances the inhibitory effects of RIPK1 on necroptosis, as opposed to blocking its participation in this process.

Keywords

cell death; necroptosis; necrostatin; receptor-interacting serine/threonine kinase 1 (RIPK1); receptor-interacting serine/threonine kinase 3 (RIPK3); tumour necrosisfactor (TNF).

3. Идентификация низкомолекулярных соединений, ингибирующих активацию провоспалительного интерлейкина IL-36G

 Белоцерковская Е. В., Сура-Труэба С., Давидович П. Б., Мартин Ш.

РОССИЙСКИЙ ИММУНОЛОГИЧЕСКИЙ ЖУРНАЛ, 2015, том 9 (18), No 2 (1)

Ключевые слова: интерлейкины, IL-36, эластаза нейтрофилов, ингибиторы эластазы, псориаз.

Аннотация. Интерлейкины группы IL-36 (IL-36α, IL-36β, IL-36γ и IL-36Ra) являются представителями семейства IL-1. Цитокин IL-36γ играет важную роль в патогенезе псориаза, в результате его активации с участием эластазы нейтрофилов. В этой связи поиск низкомолекулярных ингибиторов эластазы может стать основой нового эффективного подхода в терапии псориаза. В  ходе данной работы было протестировано 149 соединений, потенциально способных ингибировать эластазу. Тест с использованием синтетического субстрата эластазы Suc-AAPV–MCA позволил выявить четыре перспективных соединения: LCB016, LCB108, LCB112, LCB116. Эти соединения были изучены в  отношении подавления процессинга IL-36γ с использованием клеток линии HeLaIL-36R. Обнаружено, что соединение LCB016 эффективно инактивирует процессинг IL-36γ.

4. Оценка ингибирующей активности антагониста рецептора IL-36Rа в модельном эксперименте на клетках линии HеLaIL-36R

Зиновьева А.Е., Белоцерковская Е.В., Сура-Труэба С., Давидович П.Б., Мартин Ш.

РОССИЙСКИЙ ИММУНОЛОГИЧЕСКИЙ ЖУРНАЛ, 2015, том 9 (18), No 2 (1)

Ключевые слова: интерлейкины, IL-36, рецептор-антагонист IL-36Ra.

Аннотация. Взаимодействуя со специфичным рецептором IL-36R белки IL-36 принимают участие в каскаде, при инициации которого происходит экспрессия провоспалительных цитокинов. Антагонист рецептора IL-36Ra является естественным ингибитором активации каскада, блокируя рецептор IL-36R. В настоящей работе произведена оценка подавляющей активности рекомбинантного белка IL-36RaDEVD с использованием клеточной линии HeLaIL-36R и выявлено, что для ингибирования клеточного ответа на стимуляцию процессированным белком IL-36β необходим молярный избыток антагониста рецептора IL-36Ra.

5. Тезисы

Маликова А.З., Сура-Труэба С., Давидович П.Б., Мартин Ш., Гарабаджиу А.В. Изучение процессов активации цитокинов IL-36 // Медицинская иммунология. – 2015. – Т.17, спец.выпуск. – 314 с. 

6. Suppressing IL-36-driven inflammation using peptide pseudosubstrates for neutrophil proteases

Sullivan GP, Henry CM, Clancy DM, Mametnabiev T, Belotcerkovskaya E, Davidovich P, Sura-Trueba S, Garabadzhiu AV, Martin SJ  // Cell Death Dis., 7;9(3),  – 2018. –  

Link

Текст статьи

7. Identification of small molecule elastase inhibitors as potential antagonists of IL-36 cytokine

G. P. Sullivan, P. B. Davidovich, S. Sura‐Trueba, E. Belotcerkovskaya, C. M. Henry, D. M. Clancy, A. Zinoveva, T. Mametnabiev, A. V. Garabadzhiu, S. J. Martin  // FEBS Open Bio. 2018,Vol.8. N.5  – 2018. –  

Link

Текст статьи

8. Роль цитокинов семейства интерлейкина 36 в иммуно-патогенезе псориаза

Пашкин А.Ю., Хайрутдинов В.Р., Белоусова И.Э., Самцов А.В., Гарабаджиу А.В.  // Мед.иммунология,  – 2018. – Т.20, №2. С.163-170. 

Link

Текст статьи

9. Molecular structure of gaseous isatin as studied by electron diffraction and quantum chemical calculations

Alexander V. Belyakov, Kirill O. Nikolaenko, Pavel B. Davidovich, Anatolii D. Ivanov, Alexander V. Garabadzhiu, Anatolii N. Rykov, Igor F. Shishkov  // Journal of Molecular Structure,  – 2017. – 1132 (2017) 44-49. 

Link

Текст статьи

10. Colecular structure of gaseous isatin as studied by electron diffraction and quantum chemical calculations

Andrey S. Smirnov, Dmitriy N. Nikolaev, Vlad V. Gurzhiy, Sergey N. Smirnov, Vitaliy S. Suslonov, Alexander V. Garabadzhiu and Pavel B. Davidovich  // RSC Advances,  – 2017. – 2017, 7, 10070. 

Link

Текст статьи

11. Structure and catalytic properties of novel copper isatin Schiff base complexes

Andrey S. Smirnov, Luı´sa M. D. R. S. Martins, Dmitriy N. Nikolaev, Roman A. Manzhos, Vlad V. Gurzhiy, Alexander G. Krivenko, Kirill O. Nikolaenko, Alexander V. Belyakov, Alexander V. Garabadzhiu and Pavel B. Davidovich  // New Journal of Chemistry,  – 2019. – 2019, 43, 188-198. 

Link

Текст статьи

12. Production of biologically active IL-36 family cytokines through insertion of N-terminal caspase cleavage motifs

Danielle M. Clancy, Conor M. Henry, Pavel B. Davidovich, Graeme P. Sullivan1, Ekaterina Belotcerkovskaya and Seamus J. Martin  // FEBS Open Bio,  – 2016. – 6 (2016) 338–348. 

Link

Текст статьи

13. Cell death and inflammation: the case for IL-1 family cytokines as the canonical DAMPs of the immune system

Seamus J. Martin  // The FEBS Journal,  – 2016. – . 

Link

Текст статьи

14. Chemistry of 1-aza-1,3-enynes: achievements and key trends of development

Mikhail V. Karpov, Aleksandr V. Garabadzhiu, Aleksandr N. Belyaev  // Russian Chemical Reviews,  – 2016. – 2016, 85 (6) 619-636. 

Link

Текст статьи